Многолетнее, иногда двулетнее травянистое растение высотой до 40 см.
Стебли волосистые, сильно ветвящиеся.
Прикорневые листья овальные, черешковые. Стеблевые — продолговато-ланцетные, волосистые.
Цветки до 1 см в диаметре, небесно-голубые, собраны в соцветия-завитки.
Плод - чёрный островерхий орешек.
Василёк горный — многолетнее травянистое растение с прямым стеблем, неразветвленным, достигает в высоту 60 см.
Листья — прикорневые — цельные, ланцетные, собраны в розетку, стеблевые — также цельные.
Цветочные корзинки — одиночные соцветия, крупные, достигают в диаметре 6 см.
Цветки синего, сине-фиолетового цвета.
Плод — семянка.
Цветёт в июне—августе.